More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5056 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
110 aa  218  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  81.25 
 
 
115 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  81.25 
 
 
115 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  80.36 
 
 
115 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  74.77 
 
 
116 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  73.87 
 
 
116 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  64.76 
 
 
116 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  60 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  75.9 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  72.41 
 
 
116 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  75.31 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  60.18 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  75.31 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  74.07 
 
 
116 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  57.8 
 
 
117 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  55.26 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  67.9 
 
 
111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  60.23 
 
 
132 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  57.69 
 
 
125 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  46.39 
 
 
110 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  54.43 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  54.55 
 
 
109 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  51.81 
 
 
97 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  51.81 
 
 
97 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  51.81 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  45.35 
 
 
393 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.21 
 
 
357 aa  78.2  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  47.3 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  39.56 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  44.87 
 
 
375 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  49.38 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  49.38 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  37.25 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  44.58 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  47.3 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.58 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  39.81 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.33 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  42.22 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  43.48 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.58 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  39.09 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  52.05 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  37.72 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  45.68 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  43.37 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  37.61 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  40 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  42.17 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.33 
 
 
417 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  37.61 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  43.3 
 
 
247 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  41.49 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  43.53 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  42 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  42.68 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  42 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  46.24 
 
 
246 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  42 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  40.96 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  47.3 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  40.96 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  45.45 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  45.45 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40 
 
 
422 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  44.59 
 
 
411 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  40.45 
 
 
220 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>