280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0724 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 220 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  56.82 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  56.36 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  53.54 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  62.07 
 
 		 115 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  60.26 
 
 		 139 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  62.07 
 
 		 106 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  52.94 
 
 		 121 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  63.64 
 
 		 115 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 		 125 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  58.23 
 
 		 109 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 		 130 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  55.17 
 
 		 110 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 		 108 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 		 108 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 		 108 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.56 
 
 		 131 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  37.86 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  41.38 
 
 		 115 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  41.38 
 
 		 115 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40.43 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  41.38 
 
 		 115 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.62 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.68 
 
 		 398 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 		 125 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  43.18 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  39.29 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  40 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  27.66 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  40 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  39.82 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  39.78 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  37.35 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  36.75 
 
 		 116 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.36 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  37.78 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  35.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  32.62 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  38.3 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  38.54 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  38.54 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  35.96 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  43.21 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  39.51 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  35.79 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  44.44 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  36.28 
 
 		 161 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  37.76 
 
 		 375 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  40.66 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  41.77 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  43.21 
 
 		 97 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  31.11 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  36.17 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  43.04 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  31.11 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  35.79 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  35.56 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  31.11 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  43.21 
 
 		 97 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  31.11 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  31.11 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  32.22 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  37.23 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  38.3 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  40 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.37 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.43 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  37.66 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  40.7 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  38.64 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  37.11 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  36.71 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  32.08 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  35.42 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  39.78 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  35.42 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  37.63 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  37.18 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>