272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0343 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  90.26 
 
 
195 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  57.27 
 
 
220 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  56.99 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  50.98 
 
 
121 aa  104  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 
115 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  57.14 
 
 
106 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  48.98 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 
115 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  53.16 
 
 
109 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  43.4 
 
 
125 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  48.78 
 
 
130 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
108 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
110 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  51.95 
 
 
108 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  51.95 
 
 
108 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.44 
 
 
131 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.26 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  36.5 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  33.1 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.75 
 
 
422 aa  79  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.53 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.22 
 
 
357 aa  78.2  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  35.04 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  33.11 
 
 
161 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  40.66 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  32.41 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  30.4 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  36.46 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  35 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  31.97 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  37.78 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  37.04 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.21 
 
 
346 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.21 
 
 
346 aa  74.3  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  35.09 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  36.11 
 
 
157 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  33.6 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  35.71 
 
 
111 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.95 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  33.11 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  35.48 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  39.56 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  36.59 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  31.93 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  30.33 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  35.87 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  36.73 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  37.21 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  29.6 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  37.63 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  39.76 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  40.74 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  38.27 
 
 
395 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.04 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  36.56 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  37.18 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  36.56 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  30.34 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.59 
 
 
370 aa  71.2  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 
109 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  35.63 
 
 
116 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  41.03 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  34.94 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  32.17 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  32.41 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  36.46 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  34.44 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  36.05 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  36.05 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  34.44 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  40.51 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  37.97 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>