More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2181 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  67.54 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  65.49 
 
 		 116 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  65.79 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  64.6 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  64.91 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  63.16 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  64.35 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  80.49 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  63.64 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  74.07 
 
 		 111 aa  123  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  59.09 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  59.09 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  57.8 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  58.18 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  68.67 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.43 
 
 		 357 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  58.11 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  54.12 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  51.16 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  56.41 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  46.81 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  46.81 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  42.22 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  48.35 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  40.4 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  42.86 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  45.74 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  37.82 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.67 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  35.4 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.67 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  43.01 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  46.75 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  48.05 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  43.33 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  36.7 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  46.58 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  38.54 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  46.75 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  40.62 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  40.62 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  41.76 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  40.2 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  40.62 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  40.62 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  49.33 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  46.75 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  47.3 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  38.94 
 
 		 375 aa  80.5  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.78 
 
 		 398 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.05 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.05 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  41.05 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  40.22 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  45.45 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  45.21 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  46.58 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  45.21 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  45.33 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.04 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  44.59 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  44.74 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>