More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1334 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  100 
 
 
127 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  96.06 
 
 
127 aa  245  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  91.34 
 
 
127 aa  237  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  92.13 
 
 
127 aa  236  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  93.7 
 
 
126 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  93.7 
 
 
126 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  93.7 
 
 
126 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  93.7 
 
 
126 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  88.98 
 
 
127 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  91.8 
 
 
124 aa  225  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  91.8 
 
 
124 aa  225  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  91.8 
 
 
124 aa  224  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  90.98 
 
 
124 aa  223  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  86.61 
 
 
126 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  79.26 
 
 
135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  86.18 
 
 
124 aa  193  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  84.5 
 
 
129 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  77.27 
 
 
131 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  73.23 
 
 
136 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  73.23 
 
 
136 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  77.5 
 
 
131 aa  176  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  70 
 
 
138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  68.25 
 
 
135 aa  163  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  81.19 
 
 
127 aa  161  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  66.13 
 
 
154 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  72.73 
 
 
226 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  59.09 
 
 
139 aa  154  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  62.4 
 
 
153 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  59.46 
 
 
154 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  56.95 
 
 
152 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  59.57 
 
 
161 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  81.32 
 
 
157 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  60 
 
 
154 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  81.32 
 
 
157 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  58.78 
 
 
154 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  58.39 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  58.82 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  69.52 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  59.4 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  52.5 
 
 
203 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  80.46 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  57.81 
 
 
153 aa  142  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  79.31 
 
 
166 aa  140  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
143 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  58.91 
 
 
161 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  60.8 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  58.87 
 
 
163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  57.25 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  58.91 
 
 
163 aa  137  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  78.57 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  78.57 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  60.32 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  58.91 
 
 
162 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  58.91 
 
 
162 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  58.91 
 
 
162 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  56.92 
 
 
154 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  71.43 
 
 
111 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  62 
 
 
109 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  73.81 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  53.85 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  56.56 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  64.95 
 
 
154 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  63.92 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  71.08 
 
 
155 aa  123  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  47.59 
 
 
156 aa  123  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  68.6 
 
 
132 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  68.67 
 
 
156 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  47.86 
 
 
155 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  51.56 
 
 
139 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  68.67 
 
 
150 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  46.94 
 
 
170 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  68.67 
 
 
150 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  48.97 
 
 
143 aa  120  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 
148 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  46.21 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  46.97 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  67.07 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  46.97 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  67.5 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
180 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  54.35 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  54.35 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  63.41 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  62.2 
 
 
155 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  54.35 
 
 
97 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 
190 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.89 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  46.83 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  42.45 
 
 
188 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  60.98 
 
 
137 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  46.73 
 
 
393 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  48.82 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  46.77 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>