280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3170 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 93 aa  183  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  61.33 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  58.11 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  51.72 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  48.28 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  45.98 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  45.98 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  46.59 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  46.59 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  48.84 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  48.84 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3806  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  45.57 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  44.87 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  39.08 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  42.5 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  45.21 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  42.47 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.5 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 190 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.27 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  47.83 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2775  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.71 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.408446  normal  0.0989271 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  43.84 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6294  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.27 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  35.29 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4210  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.76 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.584381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  35.29 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4580  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.76 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0619542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.27 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4725  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.76 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.0181493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3160  hypothetical protein  48.53 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  35.96 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  35.96 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  37.33 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  40.54 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  39.19 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  35.96 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  35.96 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  39.19 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  37.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1744  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.490254  normal  0.469262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  38.67 
 
 		 215 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2743  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.48 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.207596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  36.49 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  39.44 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  36.49 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  36 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  35.63 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  36.9 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  34.12 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  38.75 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  34.83 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.9 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  32.43 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  38.36 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  35.62 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  36.62 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  35.62 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  36.9 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  41.18 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  36.62 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  34.21 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  35.14 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  35.14 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>