187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3160 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3160  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1744  hypothetical protein  63.75 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.490254  normal  0.469262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2775  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.22 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.408446  normal  0.0989271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.56 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4725  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.28 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.0181493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4580  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.28 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0619542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4210  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.28 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.584381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6294  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.86 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3806  surface presentation of antigens (SPOA) protein  54.55 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3347  hypothetical protein  47.89 
 
 
80 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215594  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3082  hypothetical protein  46.15 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.350654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2372  hypothetical protein  44.87 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.862262  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3578  hypothetical protein  47.83 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2162  hypothetical protein  43.48 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4891  hypothetical protein  44.93 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.752891  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1730  hypothetical protein  42.65 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.291518  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.53 
 
 
93 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  38.03 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  43.06 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  40.85 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  39.44 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  39.44 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  40.3 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  38.03 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  35.94 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  38.03 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.29 
 
 
131 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  37.68 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  37.31 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  37.31 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  34.33 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  37.31 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  33.8 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  33.78 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  33.8 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  38.46 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  36.23 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  36.92 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 
360 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.94 
 
 
357 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  33.85 
 
 
393 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  34.18 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  32.81 
 
 
156 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  32.81 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 
250 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  35.94 
 
 
401 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  41.27 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2035  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.82 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.853353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  33.87 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  33.87 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1310  hypothetical protein  38.18 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 
395 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  33.87 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2970  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.18 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.450675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  33.87 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.38 
 
 
346 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.38 
 
 
346 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>