242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6294 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6294  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
101 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  90.1 
 
 
101 aa  175  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3806  surface presentation of antigens (SPOA) protein  78.22 
 
 
122 aa  155  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4210  surface presentation of antigens (SPOA) protein  78.22 
 
 
101 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.584381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4580  surface presentation of antigens (SPOA) protein  78.22 
 
 
101 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0619542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4725  surface presentation of antigens (SPOA) protein  85.56 
 
 
101 aa  153  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.0181493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3578  hypothetical protein  55.26 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2372  hypothetical protein  53.95 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.862262  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3082  hypothetical protein  55.26 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.350654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1744  hypothetical protein  55.22 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.490254  normal  0.469262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1730  hypothetical protein  53.33 
 
 
97 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.291518  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3347  hypothetical protein  55.26 
 
 
80 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215594  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2162  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4891  hypothetical protein  52.63 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.752891  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3160  hypothetical protein  52.86 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2775  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.05 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.408446  normal  0.0989271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  45.57 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.27 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  38.67 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  38.16 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  38.67 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  38.16 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  37.33 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  40.58 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  39.13 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  41.46 
 
 
375 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  42.67 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  41.33 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  41.1 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  39.47 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  39.74 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  39.47 
 
 
393 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  41.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.84 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  41.33 
 
 
360 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  40 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  38.16 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  36.84 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  47.14 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  39.47 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  36.84 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  47.14 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  38.57 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.18 
 
 
175 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  39.74 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  35.9 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  45.71 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  35.53 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  37.68 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  37.68 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  37.68 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  35.9 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  39.44 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>