205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2775 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2775  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.408446  normal  0.0989271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1744  hypothetical protein  57.14 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.490254  normal  0.469262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3160  hypothetical protein  51.22 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6294  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.05 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4210  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.05 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.584381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4580  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.05 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0619542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4725  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.05 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.0181493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.32 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2372  hypothetical protein  46.58 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.862262  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3806  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.31 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3347  hypothetical protein  46.58 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3578  hypothetical protein  46.58 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3082  hypothetical protein  46.58 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.350654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4891  hypothetical protein  45.83 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.752891  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2162  hypothetical protein  42.25 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1730  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.291518  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.71 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  42.47 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  41.33 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  39.74 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  39.73 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  39.73 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  43.42 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  37.33 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  40.28 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  38.96 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  38.36 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  38.36 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  39.73 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  37.33 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  41.43 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  36.99 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  38.96 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  36.36 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  36.99 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.43 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  40.85 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  42.65 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  38.96 
 
 		 572 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  41.43 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 411 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  35.06 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  34.29 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  35.06 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  35.06 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  35.06 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  35.06 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  31.17 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  36.49 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  36.84 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  33.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  31.17 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  32.47 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  33.77 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  36.11 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  29.87 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  36.11 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  32.47 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  34.72 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  33.78 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  34.72 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  34.72 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.43 
 
 		 375 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  36.11 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  36.11 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  32.35 
 
 		 395 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  36.11 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  31.94 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>