More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1168 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 103 aa  203  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  62.37 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  62.37 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  62.37 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  56.84 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  72.73 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  58.7 
 
 		 190 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  58.06 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  52.58 
 
 		 99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  54.26 
 
 		 99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  55.79 
 
 		 180 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  53.47 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  53 
 
 		 188 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  58.54 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  52.08 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  51 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  52.58 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  54.76 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 401 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  51.52 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  51.11 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  52.53 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  52.53 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  52.75 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  52.17 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  56.99 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  48.57 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  52.75 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  55.42 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  58.54 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  58.54 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  51.55 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  55.32 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  52.94 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  52.63 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  58.54 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  48.51 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  58.54 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  58.54 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  48.51 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  58.54 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  54.55 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  54.76 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  49.49 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  49.49 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  49.49 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  49.49 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  48.51 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  49.49 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  58.54 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  48.48 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  55.29 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  48.48 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  48.48 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  49.49 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  53.01 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  48.48 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  50.55 
 
 		 393 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  46.46 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  50.56 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  48.48 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  56.1 
 
 		 203 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  58.54 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  53.68 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  55.32 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  47.47 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  55 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  53.68 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  53.01 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  53.01 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  47.92 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  57.32 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  47.92 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  47.47 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  51.69 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.52 
 
 		 357 aa  103  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  52.33 
 
 		 372 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  47.92 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  47.47 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  55.42 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  47.92 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  48.98 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  51.69 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  49.46 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  50.55 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  51.69 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  48.39 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.74 
 
 		 346 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>