More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1275 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  95.69 
 
 		 116 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  96.49 
 
 		 115 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  89.66 
 
 		 116 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  87.07 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  85.34 
 
 		 116 aa  200  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  85.96 
 
 		 115 aa  194  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  67.54 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  79.27 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  66.99 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  66.36 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  66.36 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  65.45 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  75.9 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  63.39 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  60.71 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  69.88 
 
 		 111 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  58.47 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.19 
 
 		 357 aa  92  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  45.83 
 
 		 393 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.87 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.98 
 
 		 93 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  48.89 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  45.57 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  48.31 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  48.31 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  43.52 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  48.31 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.58 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.16 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 		 375 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.67 
 
 		 417 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  47.5 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  45.16 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  39.05 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  38.83 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  47.06 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  39.56 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  43.12 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.56 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  47.3 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44 
 
 		 422 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  39.25 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  38.39 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  41.35 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  43.02 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  48.1 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 360 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  38.39 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  48.65 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  46.84 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  41.76 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  45.88 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  45.74 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  48.1 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  46.43 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  48.65 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  47.5 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  46.43 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  39.42 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  46.43 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  45.88 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  45.24 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  46.58 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  39.81 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.35 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  48.65 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  44.57 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  45.57 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  44.68 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>