More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1015 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  100 
 
 
111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  66.1 
 
 
118 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  66.67 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  63.81 
 
 
116 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  74.07 
 
 
117 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  72.29 
 
 
115 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  74.68 
 
 
116 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  75.95 
 
 
116 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  74.68 
 
 
116 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  69.88 
 
 
116 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  63.21 
 
 
115 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  69.88 
 
 
116 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  62.26 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  62.26 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  72.15 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  61.9 
 
 
116 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  67.9 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  60.98 
 
 
132 aa  104  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  62.82 
 
 
125 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  52.5 
 
 
393 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.29 
 
 
357 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  47.73 
 
 
401 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  52.86 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  45.57 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.75 
 
 
370 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  48.68 
 
 
381 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  46.34 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  49.32 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  48.57 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  52.86 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  50 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  42.42 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  43.82 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  53.52 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  40.78 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  50 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  46.43 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  47.14 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.98 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  48.57 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  44.44 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  50 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  48.57 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  41.24 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  45.68 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  44.44 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  51.43 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  51.43 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  51.43 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  46.58 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  46.91 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  46.91 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  47.95 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.15 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  53.25 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  45.33 
 
 
422 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  47.14 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  41.24 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  45.95 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  45.71 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  37.23 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  43.75 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  54.69 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  42.5 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  41.94 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  41.86 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  45.33 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  43.3 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  43.21 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44 
 
 
372 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.86 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  47.14 
 
 
378 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>