287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1473 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 132 aa  260  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  72.41 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  68.97 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  70.11 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  52.89 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  58.47 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  61.86 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  60.78 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  68.67 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  58.82 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  57.84 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  57.84 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  65.12 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  64.77 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  65.12 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  60.23 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  60.98 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  60.24 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  50.56 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  50.57 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  49.46 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  46.59 
 
 		 393 aa  87.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  47.67 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  47.67 
 
 		 108 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  53.16 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  53.25 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  47.62 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  53.25 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.27 
 
 		 357 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  37.01 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  51.85 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  44.19 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  37.01 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  51.32 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  46.59 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.37 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.75 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  46.05 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  52.63 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  46.59 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  44.58 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  46.24 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.33 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  53.75 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  45.24 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.66 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 		 401 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  42.71 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  47.66 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.34 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.34 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  45.12 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  35.71 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  40.86 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  48.65 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  48.05 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  47.37 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.76 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  36.28 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  43.37 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  36.13 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  44.74 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  47.3 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  36.97 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  33.66 
 
 		 375 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  46.84 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  46.84 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  49.33 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  41.84 
 
 		 375 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  46.81 
 
 		 249 aa  74.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  44.16 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.16 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  45.78 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  45.78 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>