279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3215 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
125 aa  246  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  74.77 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  68.29 
 
 
108 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  68.29 
 
 
108 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  86.52 
 
 
108 aa  157  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  85.19 
 
 
109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  71.88 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  66.99 
 
 
131 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  65.17 
 
 
115 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  64.04 
 
 
115 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  62.92 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  56.7 
 
 
139 aa  117  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 
220 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  55.43 
 
 
215 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  66.2 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  43.4 
 
 
194 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  53.19 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  50.56 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 
195 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  54.12 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  45.79 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  45.63 
 
 
111 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  47.83 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  42.48 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  51.95 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
150 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  51.95 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
150 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  46.74 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  45.74 
 
 
142 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  45.36 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  44.68 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  50 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  45.65 
 
 
161 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  46.51 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  47.56 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  51.95 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  43.52 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  44.32 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  42.45 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  42.45 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  47.56 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  47.56 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  36.43 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.46 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  45.65 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  44.68 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  44.68 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  42.59 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  36.43 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  37.7 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  37.7 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  37.7 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  37.7 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  46.25 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  47.56 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  42.5 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  46.34 
 
 
155 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  40.74 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  47.5 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  42.68 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  40.74 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  44.32 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  40.74 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  41.49 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  39.29 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  46.15 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  45 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  45 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  43.33 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  45 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  42.17 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  41.84 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  43.43 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  39.66 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  43.75 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  36.89 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>