276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0618 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  96.3 
 
 
108 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  96.3 
 
 
108 aa  204  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  84.78 
 
 
130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  86.52 
 
 
125 aa  157  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  78.57 
 
 
109 aa  140  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  75 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  79.49 
 
 
131 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  67.95 
 
 
115 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  67.95 
 
 
115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  66.67 
 
 
106 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  58.97 
 
 
139 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  56.98 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  58.44 
 
 
220 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  52.75 
 
 
215 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  49.46 
 
 
125 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
194 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  48.78 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
132 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  46.67 
 
 
152 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  50.65 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  43.01 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  50.65 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  44.12 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  45.36 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  47.13 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  48.05 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  48.19 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  44.83 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  49.35 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  44.12 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  44.12 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  42.16 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  42.16 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  42.16 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  47.25 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  47.25 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  46.99 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  46.99 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  41.58 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  43.3 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  43.3 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  45.65 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  43.3 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  45.98 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  47.5 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  41.25 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  45.78 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  46.34 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  43.33 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  44.57 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  46.75 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  46.75 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  38 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  46.75 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  40.74 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  42.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  43.02 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  41.3 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  42.71 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  39.39 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.57 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  45 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  48.68 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  41.3 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  45.05 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  37.27 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  46.25 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  42.86 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>