More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2928 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  100 
 
 		 111 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  53.64 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  50.62 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  50.62 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  50.62 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  40.2 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  40.2 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  40.2 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  39.22 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  46.84 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  46.84 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  42.45 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  46.84 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  46.84 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  45.57 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  41.18 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  46.05 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  42.35 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  35.65 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  53.16 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  41.18 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.37 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.57 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  47.44 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  46.91 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  43.75 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  42.55 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  51.35 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  46.91 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  40.59 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.05 
 
 		 346 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  39.6 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  39.6 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.05 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  50 
 
 		 372 aa  77.4  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.87 
 
 		 422 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.96 
 
 		 375 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  49.33 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  35.79 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.15 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  40.26 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  38.71 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  41.18 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  43.42 
 
 		 359 aa  74.7  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  36.9 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 393 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  34 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  39.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  39.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  39.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  39.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  41.03 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  39.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  41.03 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  38.82 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  43.04 
 
 		 401 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  34 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  34.31 
 
 		 180 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  46.99 
 
 		 246 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  40.7 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  40.79 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  40.79 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  41.89 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  41.18 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  37.78 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 375 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  36.84 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  38.37 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  46.75 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>