246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2743 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2743  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.207596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1310  hypothetical protein  90.91 
 
 		 88 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2970  surface presentation of antigens (SPOA) protein  90.91 
 
 		 88 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.450675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2945  surface presentation of antigens (SPOA) protein  64.63 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3266  flagellar motor switch protein FliN  54.65 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.994662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  42.53 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  43.24 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.48 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  39.44 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  39.19 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  41.43 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  42.31 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  41.43 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  42.25 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  42.31 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  42.31 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  37.18 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  43.66 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  41.43 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  37.18 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.84 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  40.85 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  40 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  39.74 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  37.18 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  39.74 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  37.66 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  45.83 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2280  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.66 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  39.74 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.25 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  36.25 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  38.96 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  29.73 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  36.49 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  37.5 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  37.14 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  36.49 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  37.5 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  37.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  31.43 
 
 		 393 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  36.25 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  36.25 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  36.14 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 247 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 		 357 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  31.94 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.08 
 
 		 372 aa  50.4  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  31.43 
 
 		 401 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 375 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  31.94 
 
 		 378 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  31.94 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  35 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  36.14 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  36.11 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2651  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.03 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30 
 
 		 422 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.29 
 
 		 381 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  32.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  30.65 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  39.44 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  31.43 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  29.27 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  31.94 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  36.59 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  29.87 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.82 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  31.43 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.62 
 
 		 398 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  38.03 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  29.87 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  35 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  34.29 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  35 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  37.14 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  37.14 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>