115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2945 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2945  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2743  surface presentation of antigens (SPOA) protein  64.63 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.207596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1310  hypothetical protein  59.04 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2970  surface presentation of antigens (SPOA) protein  59.04 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.450675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3266  flagellar motor switch protein FliN  50.6 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.994662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  37.84 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  37.5 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  36.46 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.96 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  35.44 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  40.7 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  30.84 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  36.59 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.08 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  37.65 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  40.96 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  36.11 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  40.96 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  40.96 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  38.27 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  38.27 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  39.76 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  38.37 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 246 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  34.57 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2280  surface presentation of antigens (SPOA) protein  34.67 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  34.52 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  34.52 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  37.08 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  34.52 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.23 
 
 		 375 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.86 
 
 		 357 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  33.73 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  30.99 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  38.57 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  37.14 
 
 		 381 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  34.12 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  38.96 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  32.86 
 
 		 375 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  28.24 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  38.96 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  38.96 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  32.84 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 359 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  31.52 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  32.84 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  30.49 
 
 		 393 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  35.85 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.85 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.87 
 
 		 372 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  37.25 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  32.86 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  34.29 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.38 
 
 		 398 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  32.91 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  29.76 
 
 		 401 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  30 
 
 		 402 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  31.51 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  30.95 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  31.48 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  31.48 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  28.75 
 
 		 375 aa  43.5  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.08 
 
 		 370 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.51 
 
 		 422 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  26.39 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  29.21 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  35.06 
 
 		 360 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.62 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  27.78 
 
 		 378 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2651  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.29 
 
 		 85 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  30.14 
 
 		 112 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  30.14 
 
 		 112 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 		 188 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  30.53 
 
 		 238 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  32.69 
 
 		 154 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  31.51 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.14 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.14 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 		 247 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  33.33 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>