271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3480 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
124 aa  245  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  88.24 
 
 
118 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  71.55 
 
 
118 aa  173  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  73.96 
 
 
118 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  66.1 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  45.45 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  45.87 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  43.52 
 
 
123 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  45.56 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  39.5 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  39.5 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  39.5 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  39.5 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  43.14 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  38.66 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  38.66 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  43.68 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  38.66 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  45.68 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  38.74 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  43.68 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  43.68 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.14 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  45.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  36.96 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  45.71 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  45.71 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 
375 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  41.89 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  40.85 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  35.87 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  35.87 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  43.94 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  44.12 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  39.78 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  44.12 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  44.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.35 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  44.12 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  34.55 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  39.02 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  38.55 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  43.94 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.51 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  43.94 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  42.65 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.96 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  37.93 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  35.11 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  41.89 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  34.91 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  39.74 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  35.45 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  40 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  39.47 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.35 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  33.64 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.35 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  39.47 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  33.04 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  33.04 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  39.47 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  33.04 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  35.63 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  39.24 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  34.94 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  32.73 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  42.42 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  35.48 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  40.26 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  32.73 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  35.87 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  32.73 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  41.18 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  32.73 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  37.08 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.03 
 
 
372 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  38.16 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  39.74 
 
 
401 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  36.78 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  36.78 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  36.78 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  36.78 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>