47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2651 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2651  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 85 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1310  hypothetical protein  45.59 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2970  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.59 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.450675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2743  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.03 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.207596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  37.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  37.93 
 
 		 249 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  37.88 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  36.36 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  34.85 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  37.74 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  34.67 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3266  flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.994662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.24 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.78 
 
 		 422 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  37.93 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  34.43 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  34.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 		 249 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  34.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  34.72 
 
 		 111 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  37.74 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2945  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.29 
 
 		 98 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  34.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  34.43 
 
 		 115 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  30.43 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.78 
 
 		 346 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.78 
 
 		 346 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.29 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  36.11 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  33.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  34.21 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  32.84 
 
 		 220 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  29.87 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2280  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.35 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 357 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  32.84 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  33.82 
 
 		 324 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  32.84 
 
 		 195 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  32.95 
 
 		 322 aa  40  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  33.82 
 
 		 324 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>