26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0741 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  100 
 
 		 324 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  98.77 
 
 		 324 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  88.89 
 
 		 324 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  66.36 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  32 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  26.11 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  26.46 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  25.82 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  32.41 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2985  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.5 
 
 		 475 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  31.65 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2211  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.9 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  42.19 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  31.3 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  20.45 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1886  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  41.27 
 
 		 387 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  19.63 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.24 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  25.95 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3123  putative type III secretion protein, FliN like  32.35 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0613641  hitchhiker  0.00272793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  32.29 
 
 		 118 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.68 
 
 		 133 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  24.87 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1396  type III secretion protein HrcQb  38.57 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  34.44 
 
 		 138 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 		 118 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>