150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  100 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  40.8 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  31.25 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  30.72 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  34.18 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.58 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  26.73 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.73 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  31.86 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  32.14 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  31.86 
 
 		 116 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1514  type III secretion system protein  36.25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.32712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1551  type III secretion system protein  36.25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  27.83 
 
 		 127 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1755  type III secretion system protein  37.5 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1529  type III secretion system protein  36.25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.46 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1925  type III secretion system protein  36.25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  35.06 
 
 		 115 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  29.5 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  34.18 
 
 		 116 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  29.89 
 
 		 138 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  28.18 
 
 		 131 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  35.16 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  30.11 
 
 		 127 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  32.35 
 
 		 115 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  32.32 
 
 		 116 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  32.32 
 
 		 116 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  29.03 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  27.05 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.53 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  29.03 
 
 		 124 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  35.9 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  29.03 
 
 		 124 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  29.03 
 
 		 124 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  29.47 
 
 		 129 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  34.44 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  29.47 
 
 		 136 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.23 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  29.47 
 
 		 136 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.65 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  27.72 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  27.84 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  26.25 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.65 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  30.85 
 
 		 110 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  33.33 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  36 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0677  type III secretion inner membrane protein SctQ  36 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  31.46 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  31.65 
 
 		 118 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.23 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  33.33 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  30.12 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  27.96 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  36 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  33.72 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  32.97 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  27.96 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2196  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  36 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1886  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  30.93 
 
 		 107 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  32.14 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  27.96 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  29.58 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  27.96 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  31.46 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  33.33 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  27.37 
 
 		 127 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  33.33 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  29.21 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  35.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  30.95 
 
 		 116 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  23.58 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  35.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  33.33 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  35.63 
 
 		 97 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  33.33 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  33.33 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  31.46 
 
 		 115 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  24.14 
 
 		 422 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.8 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 117 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  25.74 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  35.8 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  30.99 
 
 		 135 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  29.58 
 
 		 127 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.94 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  30.43 
 
 		 131 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.94 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.94 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  36 
 
 		 423 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.71 
 
 		 443 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  35.29 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  30.59 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>