32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2279 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  96.3 
 
 		 645 aa  718    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  96.3 
 
 		 645 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2196  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  95.23 
 
 		 436 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  100 
 
 		 424 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  96.3 
 
 		 645 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0677  type III secretion inner membrane protein SctQ  97.43 
 
 		 428 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129749  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  79.12 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.98 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.14 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.93 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  29.38 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  29.26 
 
 		 359 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  60.49 
 
 		 359 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0861  Hrp conserved protein HRCQ  29.01 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0450  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  33.94 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180414  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  49.35 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.51 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  40.28 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  38.96 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  36 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3123  putative type III secretion protein, FliN like  41.27 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0613641  hitchhiker  0.00272793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.67 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.22 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.22 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.22 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  38.46 
 
 		 111 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  38.36 
 
 		 249 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>