105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0044 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  40.8 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  30.38 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  30.06 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.28 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  32.41 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.41 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.41 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.6 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  27.6 
 
 		 435 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  27.96 
 
 		 190 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.43 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0450  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.16 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180414  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.57 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  27.96 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  27.96 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  36.84 
 
 		 118 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  32.61 
 
 		 118 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  29.31 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  29.31 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  29.31 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  29.31 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.96 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  30.77 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  38.96 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0677  type III secretion inner membrane protein SctQ  38.96 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129749  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.64 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  38.96 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2196  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.96 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  38.96 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  29.15 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  32.28 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.36 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  30.4 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.81 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  41.89 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  31.75 
 
 		 127 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 126 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.9 
 
 		 122 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  29.49 
 
 		 129 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  29.33 
 
 		 127 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  31.75 
 
 		 124 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 127 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  28.21 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  31.75 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.11 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  30.49 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.11 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  25.81 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2985  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  28.96 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  39.06 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.82 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.11 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  31.25 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  37.1 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  36.51 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  34.92 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  37.1 
 
 		 116 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.11 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  31.82 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.11 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  36.51 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1755  type III secretion system protein  35.71 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  31.75 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  36.51 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.26 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  34.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 111 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1529  type III secretion system protein  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1551  type III secretion system protein  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1514  type III secretion system protein  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.32712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1925  type III secretion system protein  34.29 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  35.48 
 
 		 116 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.92 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.38 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  28.92 
 
 		 109 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  30 
 
 		 148 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  35.48 
 
 		 116 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  30.1 
 
 		 188 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  32.81 
 
 		 152 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  32.81 
 
 		 152 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  27.85 
 
 		 194 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>