40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5929 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  100 
 
 		 364 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.7 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.14 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  35.58 
 
 		 435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.21 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.38 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  32.68 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  31.69 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.78 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0861  Hrp conserved protein HRCQ  30.72 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0677  type III secretion inner membrane protein SctQ  33.01 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129749  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  32.93 
 
 		 645 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  32.93 
 
 		 645 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  32.93 
 
 		 645 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2196  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  52.56 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  44.09 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  44.09 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  44.09 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  34.18 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  42.11 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  39.78 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  29.21 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  39.78 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  31.32 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0450  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.37 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180414  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  32.58 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.11 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  34.02 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  41.89 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  28.24 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  28 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  28 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3123  putative type III secretion protein, FliN like  24.75 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0613641  hitchhiker  0.00272793 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2985  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.77 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  31.16 
 
 		 135 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  28.38 
 
 		 84 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  31.43 
 
 		 149 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>