30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2196 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  97.71 
 
 		 645 aa  743    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  97.71 
 
 		 645 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2196  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  100 
 
 		 436 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  95.87 
 
 		 424 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  97.71 
 
 		 645 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0677  type III secretion inner membrane protein SctQ  97.94 
 
 		 428 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129749  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  77.2 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0429  SctQ  60.49 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1907  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  60.49 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1999  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  60.49 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0861  Hrp conserved protein HRCQ  28.88 
 
 		 354 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  50.53 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5860  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  49.47 
 
 		 326 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0450  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  33.42 
 
 		 352 aa  86.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180414  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  49.35 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  54.79 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.96 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  40.85 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  38.96 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  36 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3123  putative type III secretion protein, FliN like  41.27 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0613641  hitchhiker  0.00272793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  38.67 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  34.92 
 
 		 1000 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  38.46 
 
 		 111 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  38.36 
 
 		 249 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>