32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2080 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  100 
 
 		 323 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  99.69 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  97.55 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  98.45 
 
 		 319 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  95.22 
 
 		 335 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  95.22 
 
 		 335 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  88.85 
 
 		 320 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  30.42 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  28.85 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  28.85 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  30.42 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  28.85 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0186  Spa33  21.9 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.1 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.62 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  34.51 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.19 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5929  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  23.49 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  23.86 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  24.2 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  33.33 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5445  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.96 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4839  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.96 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0073947  decreased coverage  0.0012825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3527  Type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  27.96 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  23.57 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  23.57 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03405  type III secretion apparatus protein, YscQ/HrcQ family  25.61 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2279  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  26.22 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5643  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.97 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82857  normal  0.117856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0753  surface presentation of antigens domain-containing protein  27.19 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2438  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  36.49 
 
 		 409 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>