33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3096 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  99.34 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  99.34 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  99.01 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  30.89 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  30.57 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  36.69 
 
 		 190 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0186  Spa33  24.41 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  34.9 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.27 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.42 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.42 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  29.21 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  28.1 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  28.1 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.33 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  25.27 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  29.31 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  25.32 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  33.33 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0861  Hrp conserved protein HRCQ  26.16 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  27.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  30.61 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.47 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  24.1 
 
 		 138 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  29.59 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  31.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 138 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 138 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  30.59 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>