89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0845 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  99.68 
 
 		 315 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  100 
 
 		 315 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  96.84 
 
 		 190 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3044  surface presentation of antigens protein SpaO  30.89 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3096  surface presentation of antigens protein SpaO  30.89 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.614249  hitchhiker  0.00000334679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3201  surface presentation of antigens protein SpaO  30.89 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3081  surface presentation of antigens protein SpaO  30.89 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.892748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3013  surface presentation of antigens protein SpaO  30.89 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0186  Spa33  26.49 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  22.11 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.93 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  27.96 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0835  type III secretion system protein BsaV  24.7 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0264948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  19.15 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  39.51 
 
 		 118 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2080  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  22.78 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.355086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  23.58 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  36.23 
 
 		 118 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  32.38 
 
 		 118 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2168  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  22.78 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 194 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3755  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  23.08 
 
 		 443 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00143257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  23.4 
 
 		 138 aa  45.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0578  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  23.46 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  23.81 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  23.86 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  26.74 
 
 		 129 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  24.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  31.71 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  26.25 
 
 		 126 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  26.74 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.93 
 
 		 422 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  30.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  24.74 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4214  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  23.7 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  31.71 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  34.25 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1537  type III secretion system protein BsaV  22.43 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.402706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3592  surface presentation of antigens (SPOA) protein  34.85 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  23.66 
 
 		 127 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  34.25 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  24.24 
 
 		 124 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  23.4 
 
 		 124 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  30.67 
 
 		 97 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  28.75 
 
 		 572 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3815  type III secretion system protein  30.43 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  30.67 
 
 		 97 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  30.67 
 
 		 97 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3903  type III secretion system protein  30.43 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.180984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  25.83 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  26.25 
 
 		 127 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  25.64 
 
 		 127 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 		 136 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  33.8 
 
 		 116 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  38.71 
 
 		 116 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4736  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  23.95 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  0.482732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  25 
 
 		 124 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.33 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.52 
 
 		 370 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  38.71 
 
 		 118 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  38.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2067  type III secretion system protein BsaV  22.02 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0878838  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0747  type III secretion system protein BsaV  22.02 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3930  type III secretion system protein  30 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 346 aa  42.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>