25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3815 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3815  type III secretion system protein  100 
 
 		 320 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3903  type III secretion system protein  99.38 
 
 		 320 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.180984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3930  type III secretion system protein  97.96 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1514  type III secretion system protein  25.61 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.32712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1755  type III secretion system protein  25.7 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1925  type III secretion system protein  25.89 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1529  type III secretion system protein  25.89 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1551  type III secretion system protein  25.89 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  27.64 
 
 		 189 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5060  SepQ  19.87 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  23.39 
 
 		 190 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  30.43 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  30.43 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1839  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000604001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1784  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.073777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  22.36 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1710  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1540  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.568501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1551  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00734509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1587  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1761  flagellar motor switch protein  26.83 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 375 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2277  hypothetical protein  22.42 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165443  normal  0.719236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>