89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1514 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1514  type III secretion system protein  100 
 
 
322 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.32712  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1755  type III secretion system protein  97.83 
 
 
322 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1529  type III secretion system protein  97.83 
 
 
322 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1551  type III secretion system protein  96.89 
 
 
322 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1925  type III secretion system protein  97.2 
 
 
322 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10517  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3930  type III secretion system protein  26.41 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3903  type III secretion system protein  26.41 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.180984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3815  type III secretion system protein  25.61 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  36.25 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  30.1 
 
 
127 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  29.13 
 
 
124 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  29.13 
 
 
124 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  28.16 
 
 
126 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  28.16 
 
 
126 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  28.16 
 
 
126 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  28.16 
 
 
126 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  29.13 
 
 
124 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  28.16 
 
 
124 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  26.67 
 
 
118 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  31.71 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  22.78 
 
 
322 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  30.77 
 
 
137 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.21 
 
 
118 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.84 
 
 
133 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  31.03 
 
 
124 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 
111 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  29.11 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  30.59 
 
 
109 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  26.51 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  27.18 
 
 
127 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 
118 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  26.8 
 
 
127 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  33.85 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  32.53 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  33.85 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
154 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
163 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  28.57 
 
 
111 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  34.29 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
159 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
138 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
165 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
165 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
136 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
161 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.3 
 
 
122 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  34.38 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
124 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
143 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 
143 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  32.31 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 
189 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
154 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  26.26 
 
 
136 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  31.33 
 
 
163 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  31.33 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  31.33 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
138 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  34.33 
 
 
97 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
138 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  32.31 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  34.33 
 
 
97 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  34.33 
 
 
97 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  26.26 
 
 
136 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  32.31 
 
 
155 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  24.72 
 
 
127 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  29.23 
 
 
401 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  32.31 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5060  SepQ  20.35 
 
 
305 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1379  flagellar motor switch protein  31.34 
 
 
119 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
357 aa  42.4  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>