130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0045 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1209  type III secretion protein HrcQb  46.62 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237535  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1396  type III secretion protein HrcQb  73.13 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1886  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  47.87 
 
 		 387 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2211  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  47.25 
 
 		 386 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  32.98 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  30.85 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  26.19 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  28.3 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.88 
 
 		 375 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  31.58 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0708  flagellar motor switch protein FliY  27.71 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  31.65 
 
 		 115 aa  47.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  25.69 
 
 		 401 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01727  type III secretion system protein  27.84 
 
 		 322 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.81 
 
 		 422 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  27.13 
 
 		 393 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  31.51 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003363  type III secretion inner membrane protein YscQ  34.33 
 
 		 322 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  28.92 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  25.93 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1755  type III secretion system protein  32.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  27.96 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.14 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  30.99 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42610  type III secretion system protein  29.81 
 
 		 309 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1019  flagellar motor switch protein FliY  27.85 
 
 		 284 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.239679  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1529  type III secretion system protein  32.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1551  type III secretion system protein  32.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1514  type III secretion system protein  32.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.32712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1925  type III secretion system protein  32.84 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  29.11 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  29.89 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  29.89 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  28.09 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.5 
 
 		 357 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  29.89 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1513  flagellar motor switch protein FliY  27.45 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1440  flagellar motor switch protein FliY  26.19 
 
 		 286 aa  43.9  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000666151  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  25.29 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0044  type III secretion system protein  28.26 
 
 		 307 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  27 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0298  flagellar motor switch protein FliN  24.79 
 
 		 286 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000218083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  32.67 
 
 		 324 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  26.12 
 
 		 138 aa  43.5  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  25 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.46 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  31.68 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  23.86 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  28.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  27.5 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  27.5 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  30.14 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  26.09 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  30.47 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  24.14 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  24.58 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  27.5 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  30.14 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  26.09 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  28.17 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  27.66 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  30.3 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  26.51 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  30.38 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  28.17 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  23.64 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  27.63 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  24.76 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  23.23 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  31.51 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  25.98 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  29.89 
 
 		 115 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  24.74 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  24.74 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  28.17 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  24.74 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  29.58 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  29.47 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  23.08 
 
 		 375 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  29.47 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>