46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1209 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1209  type III secretion protein HrcQb  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237535  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1396  type III secretion protein HrcQb  63.57 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.62 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1886  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  63.24 
 
 		 387 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2211  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  39.64 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1440  flagellar motor switch protein FliY  26.26 
 
 		 286 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000666151  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0708  flagellar motor switch protein FliY  30.3 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1019  flagellar motor switch protein FliY  30.3 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.239679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  23.02 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 		 246 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  26.17 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  27.27 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  35.16 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0069  flagellar motor switch protein FliY  24.26 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  26 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.91 
 
 		 324 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0767  flagellar motor switch protein FliN  30.68 
 
 		 293 aa  42.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  39.39 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  40.91 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  22.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0298  flagellar motor switch protein FliN  28.36 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000218083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  24.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  27.64 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  24.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  31.94 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  28.05 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  28.05 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  28.05 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  28.05 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  28.05 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  24.42 
 
 		 156 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0056  flagellar motor switch protein FliY  24.26 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82232  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1513  flagellar motor switch protein FliY  28.74 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  27.03 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  28.79 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0097  flagellar motor switch protein FliY  24.26 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  24.39 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  24.42 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  28.7 
 
 		 401 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>