22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1396 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1396  type III secretion protein HrcQb  100 
 
 		 137 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1209  type III secretion protein HrcQb  63.97 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237535  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0045  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.64 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1886  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  51.04 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2211  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  39.42 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1019  flagellar motor switch protein FliY  24.43 
 
 		 284 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.239679  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0708  flagellar motor switch protein FliY  29.59 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1440  flagellar motor switch protein FliY  26.88 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000666151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0747  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  52.63 
 
 		 334 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0069  flagellar motor switch protein FliY  25.74 
 
 		 273 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  29.85 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0056  flagellar motor switch protein FliY  29.85 
 
 		 273 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0097  flagellar motor switch protein FliY  29.85 
 
 		 273 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  28.43 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1513  flagellar motor switch protein FliY  31.34 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0740  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  45.61 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0705  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.61 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148267  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0298  flagellar motor switch protein FliN  29.85 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000218083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0741  type III secretion system apparatus protein YscQ/HrcQ  43.86 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.1614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  27.27 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  32.39 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  23.97 
 
 		 401 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>