275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0238 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0056  flagellar motor switch protein FliY  71.06 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0069  flagellar motor switch protein FliY  71.06 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0097  flagellar motor switch protein FliY  71.06 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1440  flagellar motor switch protein FliY  54.9 
 
 		 286 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000666151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1019  flagellar motor switch protein FliY  55.99 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.239679  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1513  flagellar motor switch protein FliY  53.17 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0298  flagellar motor switch protein FliN  46.69 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000218083  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0708  flagellar motor switch protein FliY  44.06 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.4 
 
 		 346 aa  89.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.4 
 
 		 346 aa  89  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  44.83 
 
 		 401 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  45.16 
 
 		 393 aa  85.5  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  49.41 
 
 		 137 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  51.85 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  41.18 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  43.75 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  45.74 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.3 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.15 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  39.22 
 
 		 103 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.27 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  43.33 
 
 		 97 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  43.68 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  42.22 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  42.22 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.24 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  40.18 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  27.65 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  45.88 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  48.75 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 154 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  41.98 
 
 		 111 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  33.64 
 
 		 136 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  42.22 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  33.64 
 
 		 136 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  38.53 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  38.46 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  41.98 
 
 		 109 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  40.23 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  32.73 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  40.48 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.86 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.18 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  39.29 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 		 99 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  38.64 
 
 		 101 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  39.29 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  38.64 
 
 		 101 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  39.29 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  37.21 
 
 		 103 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  35.42 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  33.03 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  39.25 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  33.96 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  49.32 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  39.25 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  39.29 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  38.1 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  45 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  37.36 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  33.94 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  36.78 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.26 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 		 137 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  34.26 
 
 		 153 aa  72  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 		 138 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 		 139 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  35.23 
 
 		 126 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  39.76 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1635  flagellar motor switch FliN  46.15 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.115471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  35.24 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  35.35 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>