261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0708 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0708  flagellar motor switch protein FliY  100 
 
 
283 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1440  flagellar motor switch protein FliY  49.48 
 
 
286 aa  265  5e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000666151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1019  flagellar motor switch protein FliY  49.12 
 
 
284 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.239679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0298  flagellar motor switch protein FliN  46.02 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000218083  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1513  flagellar motor switch protein FliY  46.64 
 
 
276 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0056  flagellar motor switch protein FliY  45.91 
 
 
273 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0097  flagellar motor switch protein FliY  45.91 
 
 
273 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0069  flagellar motor switch protein FliY  45.88 
 
 
273 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  44.06 
 
 
279 aa  225  7e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0767  flagellar motor switch protein FliN  28.82 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  45.98 
 
 
401 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  43.96 
 
 
393 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  45.16 
 
 
375 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  51.72 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.74 
 
 
422 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  47.83 
 
 
411 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  44.32 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  25.95 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.83 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  49.4 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  53.75 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  50 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.4 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.24 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.99 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.75 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.05 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  45.68 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  48.78 
 
 
572 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  41.05 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  38.39 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  43.37 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  38.39 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  38.39 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  38.39 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  38.39 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  39.56 
 
 
155 aa  79  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  43.37 
 
 
109 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 
137 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
137 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
138 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  43.82 
 
 
175 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  39.33 
 
 
99 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  39 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  41.84 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  36.08 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  42.39 
 
 
136 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  43.18 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  43.18 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  43.18 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  43.53 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  37.08 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  35.11 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  36.36 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.35 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  32.35 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  47.3 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  40.96 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  39.29 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
124 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
143 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.1 
 
 
143 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  37.36 
 
 
159 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  39.29 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  40.48 
 
 
99 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  40.96 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  43.9 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  33.7 
 
 
127 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  33.66 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  43.75 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  37.65 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  34.38 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  42.39 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  37.08 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  37.36 
 
 
143 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  40.48 
 
 
156 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  36.26 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  35.96 
 
 
103 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  39.29 
 
 
101 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  38.2 
 
 
103 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  36.26 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>