28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3930 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3930  type III secretion system protein  100 
 
 
294 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3815  type III secretion system protein  97.96 
 
 
320 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3903  type III secretion system protein  97.62 
 
 
320 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.180984  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1514  type III secretion system protein  26.41 
 
 
322 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.32712  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1755  type III secretion system protein  25.7 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1529  type III secretion system protein  25.89 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1925  type III secretion system protein  25.89 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10517  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1551  type III secretion system protein  25.89 
 
 
322 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
370 aa  46.2  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1551  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00734509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1540  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.568501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1784  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.073777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1761  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1839  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000604001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1587  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1710  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1730  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0133868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3614  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0404203  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  30.23 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1587  flagellar motor switch protein  28.05 
 
 
119 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.40543  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3185  type III secretion apparatus protein EpaO2  23.39 
 
 
190 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
357 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0109  surface presentation of antigens (SPOA) protein  27.18 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  29.63 
 
 
393 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  26.47 
 
 
375 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 
130 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0845  surface presentation of antigens protein SpaO  30 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176147  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3019  surface presentation of antigens protein SpaO  30 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000335444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>