216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2014 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
334 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  81.74 
 
 
334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  44.82 
 
 
333 aa  311  6.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  43.65 
 
 
328 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  41.1 
 
 
329 aa  298  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  43.43 
 
 
331 aa  295  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  39.21 
 
 
344 aa  286  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  42.81 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  40.61 
 
 
343 aa  277  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  39.76 
 
 
328 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  40.36 
 
 
332 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  42.24 
 
 
334 aa  269  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  37.92 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  39.01 
 
 
323 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  38.15 
 
 
335 aa  249  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  36.96 
 
 
325 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  38.53 
 
 
327 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  37.91 
 
 
352 aa  241  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  36.7 
 
 
334 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  36.2 
 
 
332 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  35.69 
 
 
330 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  37.92 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  36.5 
 
 
329 aa  219  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  34.52 
 
 
363 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 
359 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 
359 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 
359 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 
363 aa  202  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  33.73 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  35.19 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  32.26 
 
 
375 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  32.34 
 
 
366 aa  198  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  31.74 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  36.91 
 
 
328 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  36.59 
 
 
328 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  33.44 
 
 
348 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  31.93 
 
 
353 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  30.53 
 
 
326 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  29.91 
 
 
326 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  29.39 
 
 
351 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  30.41 
 
 
325 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  29.36 
 
 
335 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  29.36 
 
 
335 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  30.69 
 
 
381 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  31.48 
 
 
334 aa  149  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  30.65 
 
 
332 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  30.65 
 
 
332 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  29.28 
 
 
334 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  30.65 
 
 
332 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  29.36 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  29.05 
 
 
332 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  30.22 
 
 
333 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.05 
 
 
332 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.05 
 
 
332 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  29.36 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  29.91 
 
 
326 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  30.21 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 
332 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 
332 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 
332 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 
332 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  29.05 
 
 
332 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  29.61 
 
 
332 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  27.81 
 
 
328 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
332 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  30.14 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  28.79 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  27.86 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  27.79 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  27.66 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  27.71 
 
 
335 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 
326 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 
334 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  26.28 
 
 
314 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  26.83 
 
 
324 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.84 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  27.67 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  28.74 
 
 
333 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  28.87 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  28.26 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
337 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 
334 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  28.87 
 
 
325 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  25.62 
 
 
322 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.33 
 
 
338 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  25.91 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  26.93 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  27.69 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>