221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0041 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  93.67 
 
 
332 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  93.98 
 
 
332 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  97.59 
 
 
332 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  96.99 
 
 
332 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  95.78 
 
 
332 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  94.58 
 
 
332 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  97.59 
 
 
332 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
332 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  99.7 
 
 
332 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  97.59 
 
 
332 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  93.67 
 
 
332 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  93.67 
 
 
332 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  93.98 
 
 
332 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  93.98 
 
 
332 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  93.67 
 
 
332 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  89.16 
 
 
332 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  88.25 
 
 
332 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  88.86 
 
 
332 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  70.9 
 
 
335 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  70.9 
 
 
335 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  66.15 
 
 
335 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  66.88 
 
 
335 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  64.72 
 
 
334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  63.78 
 
 
326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  60.53 
 
 
336 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  59.17 
 
 
337 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  63.44 
 
 
338 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  58.16 
 
 
333 aa  417  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  60.87 
 
 
336 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  53.75 
 
 
333 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  54.52 
 
 
334 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  54.18 
 
 
334 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  54.18 
 
 
334 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  53.52 
 
 
329 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  53.42 
 
 
334 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  53.42 
 
 
334 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  53.89 
 
 
334 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  51.08 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  50.62 
 
 
338 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  52.35 
 
 
337 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  53.27 
 
 
334 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  53.27 
 
 
334 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  53.27 
 
 
334 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  53.27 
 
 
334 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  53.27 
 
 
334 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  52.81 
 
 
334 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  51.56 
 
 
337 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  49.85 
 
 
338 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  51.27 
 
 
333 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
334 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
334 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
334 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
334 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
334 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
334 aa  345  8e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  50.95 
 
 
333 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  50.48 
 
 
343 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  50.63 
 
 
333 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  47.55 
 
 
326 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  47.98 
 
 
324 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  43.83 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  46.54 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  45.23 
 
 
381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  42.51 
 
 
343 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  42.51 
 
 
343 aa  301  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  42.51 
 
 
343 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  42.51 
 
 
343 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  42.81 
 
 
342 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  43.08 
 
 
341 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  42.81 
 
 
342 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  42.81 
 
 
342 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  44.73 
 
 
334 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  41.46 
 
 
354 aa  296  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
342 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  44.34 
 
 
337 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  44.34 
 
 
337 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
343 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 
322 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 
342 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  43.3 
 
 
322 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
342 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  46.03 
 
 
332 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  41.82 
 
 
336 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  43.04 
 
 
322 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
322 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  44.55 
 
 
333 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
322 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
322 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  44.31 
 
 
324 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  43.04 
 
 
322 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  40.12 
 
 
352 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  41.8 
 
 
341 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  39.26 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  41.36 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  43.4 
 
 
347 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  40.43 
 
 
348 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  43.67 
 
 
323 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  40.62 
 
 
348 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
349 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>