225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0477 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 328 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  64.63 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  58.72 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  50.45 
 
 		 332 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  47.24 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  42.55 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  43.96 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  42.77 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  41.28 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  43.96 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  42.9 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  39.76 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  41.23 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  40.92 
 
 		 335 aa  268  7e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  42.38 
 
 		 352 aa  265  5.999999999999999e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  37.31 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  36.75 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  36.05 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  35.76 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  36.31 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  37.58 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  37.19 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  38.11 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  33.43 
 
 		 372 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  37.38 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  37.07 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  34.53 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  33.13 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  34.36 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  34.36 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  34.36 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  30.91 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  33.84 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 		 375 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  29.14 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  28.08 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  26.05 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  29.88 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  26.99 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.85 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  26.55 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.16 
 
 		 395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.45 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  29.66 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  27.33 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  27.33 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  26.15 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  26.69 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  27.02 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.66 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  25.75 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.68 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  26.8 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  28.73 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  27.55 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  23.85 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  22.94 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  25.45 
 
 		 354 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  25.91 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  25.69 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  23.38 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  23.38 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  24.62 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  25.99 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  25.85 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.94 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.94 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  24.62 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>