216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2500 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 375 aa  763    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  37.22 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  36.39 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  35.34 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  35.53 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  35.31 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  34.43 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  32.4 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  31.82 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  35.44 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  32.22 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  32.22 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  32.22 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  32.96 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  35.96 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  34.2 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  37.76 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  34.85 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  31.84 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  33.33 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  32.06 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  32.26 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  31.27 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  31.72 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  35.4 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  32.23 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  34.93 
 
 		 328 aa  195  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  33.04 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  32.27 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  32.15 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  32.36 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  32.44 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  30.18 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  33.53 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  29.85 
 
 		 326 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  29.71 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  29.85 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.66 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  29.68 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  28.4 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.51 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  29.25 
 
 		 326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  30.15 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  29.64 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  29.2 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.72 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  27.65 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  27.94 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  27.65 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  30.27 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  29.46 
 
 		 325 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  27.68 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  28.36 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  25.89 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  31.51 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  25.89 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  29.27 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  31.51 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  26.89 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  27.19 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  27.03 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.97 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  30.17 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  26.33 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  27.46 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  27.51 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  24.26 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  26.59 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  26.55 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  26.59 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  25.53 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>