201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2334 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 320 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  38.44 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  36.82 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  37.89 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  35.89 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  36.67 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  30.43 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  31.85 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  32.62 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  29.35 
 
 		 333 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  32.2 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  31.62 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  30.85 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2979  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.27 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  30.53 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  29.9 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  29.02 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  33.45 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  30.17 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  28.78 
 
 		 372 aa  132  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  28.08 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  27.12 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  31.06 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  30.8 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  28.81 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  30.22 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  28.9 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  29.83 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  31.94 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  27.1 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  25.76 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  26.74 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  26.89 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  26.74 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  30.04 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  25.09 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  26 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  28.14 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0150  surface presentation of antigens (SPOA) protein  29.09 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.81 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  27.8 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  26 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  26.4 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  26.27 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  27.43 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.9 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  24.4 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  23.94 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  25.6 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  24.12 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  24 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  24.4 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  24.8 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  24.9 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  23.92 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  27.9 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  26.8 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  27.67 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  24.42 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  23.55 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  27.9 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.12 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.12 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.12 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  23.74 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  26.1 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  26.92 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  26.13 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  24.19 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  23.72 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  24.81 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  24.51 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  24.51 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>