216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2014 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  56.71 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2979  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.05 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  36.86 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  36.39 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  35.84 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  35.89 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  32.88 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  31.8 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  33.45 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  33.79 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  31.16 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  29.49 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  30.24 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  29.55 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  30.26 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  29.9 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  28.03 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  24.66 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  26.76 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  26.55 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  26.71 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  26.42 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  23.95 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  24.42 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  23.43 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  25.69 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 367 aa  92.4  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  26.5 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  26.5 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  29.24 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  26.5 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  23.19 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  29.24 
 
 		 353 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  28.07 
 
 		 363 aa  89  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  21.25 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  21.61 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  21.63 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  22.06 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  23.41 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  20.96 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  22.88 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  22.07 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  23.53 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.58 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  23.79 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.18 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  22.14 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  24.34 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  24.83 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0150  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.47 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  25.65 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  25.65 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  22.76 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.04 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  24.24 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  24.24 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  20.49 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  20.94 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  23.69 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  23.71 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  23.74 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  23.69 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  22.71 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  21.75 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  23.97 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  23.97 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  24.6 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>