210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0746 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
335 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  41.83 
 
 
314 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  42.86 
 
 
321 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  41.55 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  37.89 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  35.76 
 
 
308 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  37.25 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2979  surface presentation of antigens (SPOA) protein  35.55 
 
 
298 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  29.47 
 
 
344 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  29.97 
 
 
343 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  28.9 
 
 
328 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  27.66 
 
 
329 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  25.64 
 
 
333 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  29.12 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  28.97 
 
 
323 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  29.12 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
329 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  24.65 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  28.25 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  28.41 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  28.2 
 
 
331 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  28.12 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  32.07 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  27.42 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  26.3 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  26.49 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  34.57 
 
 
359 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  27.31 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
330 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  28.77 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
367 aa  112  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  24.25 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  26.92 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 
353 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 
372 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
351 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  26.47 
 
 
332 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  25.7 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  24.21 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  25.72 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0150  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.65 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  25.34 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1539  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1729  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3615  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0062  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.49 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1783  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00985901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1760  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1550  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000560769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1586  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.676139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1838  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000428754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.29 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1378  flagellar motor switch protein FliM  22.98 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000132056  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  23.1 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  24.52 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  22.44 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  24.16 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  24.35 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  24.35 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  24.35 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  24.35 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  24.35 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  23.76 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  24.16 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  25.49 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  23.48 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  25.1 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  24.37 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  23.57 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  22.41 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  22.95 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  24.32 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  22.3 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  19.92 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  21.38 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  23.44 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  22.14 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  23.44 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  21.32 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  22.3 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  22.05 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  21.55 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>