215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3482 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
395 aa  809    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  44.96 
 
 
384 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  45.83 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  44.98 
 
 
400 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  46.88 
 
 
404 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  46.25 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  46.13 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  43.06 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  45.68 
 
 
401 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  46.3 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  47.34 
 
 
377 aa  302  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  45.05 
 
 
374 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  42.32 
 
 
403 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  43.38 
 
 
403 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  42.77 
 
 
405 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  41.99 
 
 
404 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  43.08 
 
 
406 aa  292  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  43.08 
 
 
406 aa  292  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  39.68 
 
 
337 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  28.97 
 
 
335 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 
344 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.62 
 
 
340 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  29.79 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
326 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  26.96 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 
326 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  26.71 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  29.13 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  28.19 
 
 
311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  29.08 
 
 
325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  29.23 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 
348 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  28.42 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 
325 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 
337 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 
337 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  26.89 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  25.89 
 
 
342 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 
334 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  26.82 
 
 
338 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  26.96 
 
 
336 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 
334 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  27.62 
 
 
337 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 
334 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
309 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  26.32 
 
 
381 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  28.66 
 
 
328 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  27.93 
 
 
352 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.42 
 
 
314 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  25.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  26.95 
 
 
333 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.98 
 
 
326 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  28.3 
 
 
334 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 
342 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 
341 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
331 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 
341 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.15 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  26.59 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  25.98 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  25.32 
 
 
322 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.7 
 
 
326 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  24.4 
 
 
343 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  24.13 
 
 
332 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  23.49 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  24.17 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  23.87 
 
 
332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  26.33 
 
 
342 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.68 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.68 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  23.56 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.68 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  24.69 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  25.27 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  24.69 
 
 
342 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  24.69 
 
 
342 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  25.27 
 
 
343 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  29.51 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
332 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
332 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
332 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  29.96 
 
 
327 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  23.32 
 
 
335 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 
349 aa  116  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>