218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2734 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
325 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  72.31 
 
 
326 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  71.69 
 
 
326 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  72.62 
 
 
326 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  72.62 
 
 
326 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
322 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  40.51 
 
 
322 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
322 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  40.95 
 
 
322 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  40.95 
 
 
322 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  41.69 
 
 
326 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  42.01 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  39.87 
 
 
322 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  41.59 
 
 
381 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  39.56 
 
 
322 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  39.43 
 
 
324 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  43.25 
 
 
348 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  41.51 
 
 
333 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  41.51 
 
 
342 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  42.55 
 
 
334 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  42.01 
 
 
337 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  42.01 
 
 
337 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 
332 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  40.67 
 
 
342 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  42.91 
 
 
348 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  39.87 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  39.56 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  42.21 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  41.51 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  42.19 
 
 
323 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  41.82 
 
 
352 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  42.19 
 
 
323 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  40.68 
 
 
352 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  39.63 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  39.63 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  40.13 
 
 
336 aa  241  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  41.51 
 
 
334 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  41.28 
 
 
338 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  41.87 
 
 
341 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  43.11 
 
 
349 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  39.32 
 
 
343 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  37.97 
 
 
335 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  37.97 
 
 
335 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  38.22 
 
 
347 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  40.51 
 
 
323 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  42.4 
 
 
342 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  38.63 
 
 
342 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  38.63 
 
 
342 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  38.99 
 
 
342 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  38.99 
 
 
342 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  40.5 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  42.31 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  37.54 
 
 
331 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  39.06 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  38.72 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  39.81 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  41.51 
 
 
325 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  38.32 
 
 
343 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  36.92 
 
 
334 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  39.12 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  36.16 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  36.16 
 
 
332 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  35.42 
 
 
332 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  35.42 
 
 
332 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  36.16 
 
 
332 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  35.42 
 
 
332 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  40.69 
 
 
395 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  35.22 
 
 
332 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  35.74 
 
 
332 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  37.92 
 
 
337 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  35.44 
 
 
332 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  35.53 
 
 
332 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  35.44 
 
 
332 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  35.44 
 
 
332 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  35.42 
 
 
332 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  38.24 
 
 
325 aa  228  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  35.13 
 
 
332 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  37.93 
 
 
325 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  35.53 
 
 
332 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  35.13 
 
 
332 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  35.13 
 
 
332 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  35.13 
 
 
332 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  37.93 
 
 
328 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  37.62 
 
 
336 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  36.48 
 
 
339 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  38.38 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  37.92 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  38.81 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  37.68 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  39.47 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  35.87 
 
 
334 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  35.87 
 
 
334 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  36.36 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  34.37 
 
 
335 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  35.76 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  34.18 
 
 
350 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  34.18 
 
 
333 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  33.23 
 
 
343 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 
344 aa  185  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  33.86 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>