205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4200 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 403 aa  806    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  79.8 
 
 		 404 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  80.34 
 
 		 406 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  80.34 
 
 		 406 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  94.31 
 
 		 403 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  81.53 
 
 		 405 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  55.32 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  55.08 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  54.11 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  54.81 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  54.78 
 
 		 401 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  53.67 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  53.21 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  51.94 
 
 		 384 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  55.26 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  59.94 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  56.78 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  43.38 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  44.48 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  30.28 
 
 		 326 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  30.65 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  31.42 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  33.1 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  32.39 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  31.45 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  30.66 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  28.95 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  29.28 
 
 		 332 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  28.95 
 
 		 332 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.24 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  30.11 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  30.11 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  31.37 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  28.26 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  29.66 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  29.28 
 
 		 332 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  31.49 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  30.71 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  28.29 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  28.29 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  28.14 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  28.29 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  28.43 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  30.37 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  28.08 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  30.28 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  28.43 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  28.26 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  30.36 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  27.81 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  27.6 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  28.43 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  30.45 
 
 		 334 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  27.55 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  28.98 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  28.36 
 
 		 347 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  30.07 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  27.74 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  29.43 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  30.1 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  29.08 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  27.14 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  29.12 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  28.32 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  28.52 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  28.52 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  27.96 
 
 		 341 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  27.7 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  27.1 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>