224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1969 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 322 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  98.45 
 
 		 322 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  90.06 
 
 		 322 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  90.06 
 
 		 322 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  89.75 
 
 		 322 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  89.75 
 
 		 322 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  89.75 
 
 		 322 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  85.67 
 
 		 323 aa  567  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  85.71 
 
 		 323 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  85.67 
 
 		 323 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  72.2 
 
 		 332 aa  474  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  70.53 
 
 		 333 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  65.12 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  67.19 
 
 		 324 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  61.37 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  60.62 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  60.06 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  58.44 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  61.25 
 
 		 342 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  58.13 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  58.13 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  60.38 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  57.81 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  60 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  61.25 
 
 		 395 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  59.06 
 
 		 342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  58.44 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  57.1 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  58.13 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  58.13 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  58.13 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  58.44 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  57.32 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  57.72 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  57.99 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  57.05 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  57.81 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  57.05 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  56.37 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  56.74 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  56.01 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  56.01 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  51.08 
 
 		 347 aa  358  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  49.69 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  46.52 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  46.52 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  46.79 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  45.28 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  47.13 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  45.89 
 
 		 335 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  45.62 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  43.99 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  43.99 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  43.99 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  43.61 
 
 		 332 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  43.61 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  43.67 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  43.52 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  43.3 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  43.71 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  42.37 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  44.3 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  43.61 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  42.46 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  40.95 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  39.81 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  40.13 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  40.44 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  40.44 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  40.62 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  42.22 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  38.54 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  42.32 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  41.36 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  43.17 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  43.17 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  42.01 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  39.87 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  42.04 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  39.87 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  42.5 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  42.01 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  42.75 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>