222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1703 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
334 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  99.7 
 
 
334 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  95.51 
 
 
334 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  95.51 
 
 
334 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  95.51 
 
 
334 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  99.7 
 
 
334 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  99.7 
 
 
334 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  95.51 
 
 
334 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  93.41 
 
 
334 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  95.51 
 
 
334 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  99.7 
 
 
334 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  99.7 
 
 
334 aa  675    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  84.48 
 
 
337 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  84.18 
 
 
337 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  83.23 
 
 
333 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  82.09 
 
 
338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  82.93 
 
 
333 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  83.23 
 
 
333 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  82.76 
 
 
343 aa  554  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  58.81 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  60.12 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  53.78 
 
 
336 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  52.41 
 
 
337 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
332 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  51.84 
 
 
332 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  51.53 
 
 
332 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  52.02 
 
 
332 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  52.02 
 
 
332 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  52.02 
 
 
332 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  52.02 
 
 
332 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
332 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  50.91 
 
 
332 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  50.92 
 
 
332 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  49.84 
 
 
335 aa  342  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  50 
 
 
335 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  50 
 
 
335 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  49.85 
 
 
334 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  50.31 
 
 
335 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  48.29 
 
 
326 aa  329  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  49.22 
 
 
333 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  49.22 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  47.76 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  49.07 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  46.42 
 
 
334 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  47.22 
 
 
334 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  47.22 
 
 
334 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  46.73 
 
 
334 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  44.51 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  44.1 
 
 
334 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  42.55 
 
 
333 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  42.32 
 
 
326 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  45.08 
 
 
337 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  45.08 
 
 
337 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  42.06 
 
 
336 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  40.68 
 
 
354 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  39.3 
 
 
352 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  42.02 
 
 
395 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  40.89 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  43.75 
 
 
334 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  39.43 
 
 
341 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  39.62 
 
 
342 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  41.08 
 
 
324 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  40.38 
 
 
342 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
343 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
343 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
343 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
343 aa  255  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  40.38 
 
 
342 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  42.55 
 
 
322 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  42.55 
 
 
322 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  42.55 
 
 
322 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  40.58 
 
 
342 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  40.58 
 
 
342 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  39.43 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  38.66 
 
 
342 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  39.62 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  42.24 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
343 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  39.62 
 
 
342 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
347 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  41.12 
 
 
322 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  42.09 
 
 
333 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  37.85 
 
 
348 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  37.74 
 
 
343 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  42.54 
 
 
323 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  42.54 
 
 
323 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  41.74 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  41.61 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  42.54 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  43.93 
 
 
381 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  37.54 
 
 
348 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  39.87 
 
 
324 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>