197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0621 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
335 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  90.59 
 
 
340 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  95.24 
 
 
344 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  71.67 
 
 
303 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  64.41 
 
 
309 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  49.48 
 
 
311 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  43.69 
 
 
313 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.67 
 
 
314 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  32.98 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  33.22 
 
 
376 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  33.81 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  32.14 
 
 
404 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  31.47 
 
 
400 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  28.97 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  30.77 
 
 
401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  30.77 
 
 
401 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
405 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
406 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
406 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  30.66 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  32.98 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  32.58 
 
 
400 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  30.66 
 
 
403 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  29.37 
 
 
404 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  32.28 
 
 
400 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  31.89 
 
 
401 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
337 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.61 
 
 
317 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  26.96 
 
 
316 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.82 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  28.12 
 
 
332 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  28.12 
 
 
332 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 
332 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 
332 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.76 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.76 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.76 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.41 
 
 
332 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  23.13 
 
 
323 aa  105  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  26.77 
 
 
333 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  25.7 
 
 
332 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  25.35 
 
 
332 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  25.7 
 
 
332 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  24.82 
 
 
395 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  25.98 
 
 
338 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  24.54 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  25.32 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  25.74 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  21.61 
 
 
341 aa  95.9  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  24.36 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 
336 aa  95.9  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  22.68 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  24.36 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  21.61 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  22.34 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  22.68 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
343 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  22.59 
 
 
333 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  22.38 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  21.61 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  22.71 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  25.43 
 
 
326 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  25.18 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  23.16 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  23.44 
 
 
322 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  22.71 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.18 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.36 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  24.11 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>